קפליצקי היה בן 71. הסיבה למותו הפתאומי היא סדרה של בעיות הקשורות ליישום פרויקטו לבניין החדש של הספרייה הלאומית הצ'כית: למרות העובדה כי גרסת הלשכה העתידית שלו מערכות זכתה בתחרות בינלאומית, כעת יישומה אינו סביר. מצד אחד, אזרחים רבים, כולל נכבדים, התנגדו לפרויקט, ורואים את הצורות העקומות והצבעים הבהירים של הבניין העתידי כתוספת בלתי מקובלת לנוף העירוני הקיים של פראג (אם כי תוכנן לבנות את הספרייה בפארק. אזור, מחוץ לעיר העתיקה). מנגד, אדריכלים צ'כים ראו הפרות בנוהל התחרות שהושלמה שפגעה בזכויותיהם, ודרשו לשנות את התוצאות.
קפליצקי, שעזב את צ'כיה בשנת 1968, לאחר הצגת הכוחות הסובייטים, ראה בבניין הראשון שלו במולדתו מאז אותה תקופה סמל לשובו ולקח תפנית אירועים כזו בכאב רב. השפה הנועזת של האדריכלות שלו, שהקדימה את זמנה ומאתגרת את החשיבה הפיליסטית, עוררה תמיד תגובה מעורפלת בציבור - כולל לקוחות ובעלי שלטון, אך האדריכל נמנע מפשרות - והפעם הוא לא עשה הנחות ובנמרצות. הגן על גרסתו לפרויקט …
באופן כללי, למרות פרס סטרלינג לשנת 1999 למרכז העיתונות של אצטדיון הקריקט בלורדס בלונדון והפופולריות של חנות הכלבו שלו סלפרידג'ס בבירמינגהם, הפוטנציאל של איאן קפליצקי כארכיטקט לא מומש במלואו: אדריכלות - פיטר קוק, לשעבר עורך ארכיטקטורת סקירה פול פינץ ', המבקר קן פאוול. נורמן פוסטר, שאיתו שיתף פעולה קפליקי בין השנים 1979–1983, אמר שהוא אדריכל גדול, עמית מוערך וחבר טוב.
